CONFORMATIONAL ANALYSIS IN 18-MEMBERED MACROLIDE ANTIBIOTICS BASED ON MOLECULAR MECHANICS.

  • SALAH BELAIDI Department of chemistry, Faculty of sciences, University of Biskra, BP 145, 07000 Biskra
  • KARIMA ZITOUNI Department of chemistry, Faculty of sciences, University of Ouargla, BP 511, 30000, Ouargla
  • MAHMOUD OMARI Department of chemistry, Faculty of sciences, University of Biskra, BP 145, 07000 Biskra

Résumé

Conformational analysis of macrolides with 18-ring membered has been carried out using molecular mechanics calculations
and molecular dynamics. A high conformational mobility of no complexed macrocycles has been obtained and an important
stereoselectivity has been observed for the complexed macrocycles. For 18d macrolide, which was presented by a privileged
conformer with 20.1% without complex, was populated with 50.1% in presence of Fe(CO)3. For the most privileged conformer
geometry; the α,β-unsaturated ester group has an s-cis conformation with a torsion angle φ1: O19-C2-C3-C4 = 14.5° for
macrocycle 18d macrolide and φ1: O19-C2-C3-C4 = 25.0° for 18s macrolide. The diene group has an s-trans conformation
with a torsion angle φ2:C11-C12-C13-C14 = 169.4° for 18d macrolide and φ2:C10-C11-C12-C13 = 179.5° for 18s macrolide.

 

 

L’analyse conformationnelle des macrolides à 18 chaînons a été réalisée par des calculs de mécanique moléculaire et de
dynamique moléculaire. Une mobilité conformationnelle élevée a été obtenue pour les macrocycles non complexés et une
stéréosélectivité importante a été observé pour les macrocycles complexés. Pour le macrolide 18d, qui a été présenté par un
conformère privilégié avec 20.1% sans complexe, est devenu 50.1% en présence de Fe(CO)3
Pour la géométrie du conformère le plus privilégiée; le système d’ester α,β-insaturé, a une conformation s-cis avec un angle de
torsion φ1 : O19-C2-C3-C4 = 14.5° pour le macrolide 18d et φ1 : O19-C2-C3-C4 = 25.0° pour le macrolide 18s. Le système
diène a une conformation s-trans avec un angle de torsion φ2 : C11-C12-C13-C14 = 169.4° pour macrolide 18d et φ2:C10-C11-
C12-C13 = 179.5° pour macrolide 18s.

Références

[1] W. Kaouru, P. Brian, M. Roberge , J. Am. Chem. Soc.,
2007, 129, 508
[2] H. Tomoo, F. Kazutaka, T. Kayoki, I. Takeshi, J.
Antibio.; 2006, 59, 597.
[3] C. Brian, and H. Clayton, Org.Lett. 2000, 2, 27.
[4] S. Omura, Macrolide Antibiotics Chemistry Biology
and practice; Academic press, New-york 1984.
[5] W. C. Still and I. Galynker, Tetrahedron. 1981, 37,
3981.
[6] D.M. Grée, CJ. Kermarrec, J.T. Martelli, R. Grée, J.P.
.Lellouche, and L.Toupet. J.Org.Chem.; 1996, 61,
1918.
[7] H. Chermette, Spectra 2000. 1993, 291, 255.
[8] N.L. Allinger, J.Am. chem. Soc. 1977, 99, 8127.
[9] Pro Chemist Model (Logiciel de modélisation
moléculaire) Editions Cadcom, St Denis France
(2002).
[10] C.S. Chem 3D Pro, Molecular Modeling and Analysis,
Cambridge Soft Corporation, 875 Massachusetts,
02139 U.S.A (2003).
[11] HyperChem (Molecular Modeling System)
Hypercube, Inc., 1115 NW 4th Street, Gainesville,
FL32601; USA, (2001).
[12] J. Koca, J. Mol. Structr. 1993, 291, 255.
[13] S. Belaidi, A. Dibi and M. Omari, Turk. J. Chem.,
2002, 26, 491.
[14] S. Belaidi, M. Laabassi, R. Grée et A. Botrel, sci.
stud. res., 2003, 4, 27. (Review Paper)
[15] S. Belaidi, T. Lanez, M. Omari, A. Botrel, Asian J.
Chem. , 2005, 17, 859.
[16] M. Saunders, K. Houk, Y. Wu,W. Still, M. Lipton, G.
Changand W. Guida, J.Am. Chem. Soc. 1990,
112,1419.
[17] S. Belaidi, M. Omari A. Dibi and T. Lanez, An. Fac.
Sci. Ing, 2006, 1, 1-4.
[18] S. Belaidi, M. Omari, T. Lanez et A. dibi, J. Soc.
Alger. Chim., 2004, 14, 27.
[19] S. Belaidi, M. Laabassi, R. Grée et A. Botrel, Rev.
Roum. Chim., 2005, 9-10, 759.
[20] T.Yamazaki, M. Ando, T. Kitazume, T. Kubota and
M. Omura, Org. Lett.,1999,
6,
905
[21] S. V. Ley and L.R. Cox, Chem. Soc. Rev., 1998, 27,
301.
Comment citer
BELAIDI, SALAH; ZITOUNI, KARIMA; OMARI, MAHMOUD. CONFORMATIONAL ANALYSIS IN 18-MEMBERED MACROLIDE ANTIBIOTICS BASED ON MOLECULAR MECHANICS.. Courrier du Savoir, [S.l.], v. 9, mai 2014. ISSN 1112-3338. Disponible à l'adresse : >https://revues.univ-biskra.dz/index.php/cds/article/view/499>. Date de consultation : 19 avr. 2024
Rubrique
Articles